FEI Amira 6(三維可視化軟件) v6.0.1官方版

FEI Amira 6是澳大利亞Visage Imaging公司出品的一款功能強(qiáng)大的專(zhuān)業(yè)可視化和三維重構(gòu)軟件，常用于可視化操作、生命科學(xué)研究和了解來(lái)自于計(jì)算機(jī)斷層掃描、顯微鏡、MRI及許多其他成像形式的數(shù)據(jù)。它能夠識(shí)別生命科學(xué)、生物醫(yī)學(xué)的數(shù)據(jù)來(lái)源、方式及類(lèi)型，提供XBioFormats、XNeuro、XMolecular、XImagePAQ、XMesh等多種可視化技術(shù)和交互操作功能。作為分子和細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)以及生物工程學(xué)等多個(gè)研究領(lǐng)域的專(zhuān)家公認(rèn)好用的軟件，Amira不管是從重建的幾何體到任何可導(dǎo)入的三維數(shù)據(jù)（包括時(shí)間序列），都能獲得優(yōu)秀的效果。歡迎有需求的用戶前來(lái)免費(fèi)下載。

軟件特色

1、多用途一個(gè)跨學(xué)科工作的工具。
2、靈活的選項(xiàng)包配置用戶的需要。
3、高效利用最新的顯卡和處理器。
4、易于使用直觀的用戶界面和偉大的文檔。
5、成本效益多選項(xiàng)和靈活的許可證模式。
6、處理大型數(shù)據(jù)非常大的數(shù)據(jù)集可以方便地使用特定的讀者訪問(wèn)。
7、可擴(kuò)展C ++編碼向?qū)?，用于技術(shù)擴(kuò)展和定制。
8、支持直接的客戶支持與高水平的互動(dòng)。
9、創(chuàng)新技術(shù)總是更新到最新的創(chuàng)新。

amira軟件主要功能

1、處理和重構(gòu)
通過(guò)各種數(shù)字過(guò)濾器及交互式編輯器來(lái)處理圖像，對(duì)圖像體內(nèi)的組織和區(qū)域進(jìn)行重構(gòu)。
①圖像過(guò)濾
②曲面的生成
③圖像選取
④切片對(duì)齊校正
⑤自動(dòng)和手動(dòng)配準(zhǔn)
⑥體積和圖像取樣
⑦體積裁切
⑧對(duì)體積數(shù)據(jù)直接編輯
⑨曲面資料編輯
⑩數(shù)據(jù)類(lèi)型轉(zhuǎn)換
?腳本編輯
?三維多平面重建視圖融合
?三維多平面重建視圖中自動(dòng)及手動(dòng)配準(zhǔn)
2、可視化探索狀語(yǔ)從句
擁有快速交互式及高質(zhì)量的可視化技術(shù)，您可以輕易的通過(guò)裁剪和配色來(lái)探索體數(shù)據(jù)。
①正切面，斜切面及曲線切片
②多分辨率的體渲染及陰影
③曲面渲染
④等值線和等值面
⑤多色頻的圖像可視化
⑥圖像融合
⑦高度場(chǎng)
⑧正切面投影
⑨線狀結(jié)構(gòu)的可視化追蹤
⑩三維特定區(qū)域的選取
?裁切與切割
?時(shí)間序列數(shù)據(jù)可視化
?三維平面多查看重建數(shù)據(jù)復(fù)雜集
3、分析量化狀語(yǔ)從句
利用高級(jí)的統(tǒng)計(jì)工具對(duì)體進(jìn)行面和網(wǎng)格分析，交互的完成對(duì)距離，角度，面和體的幾何測(cè)量；阿米拉同MATLAB相結(jié)合，執(zhí)行模擬和先進(jìn)的數(shù)字分析功能。
①組織材料分析統(tǒng)計(jì)
②體積和曲面的測(cè)量
③二維/三維線性測(cè)量及標(biāo)注
④聯(lián)合定位分析
⑤數(shù)值運(yùn)算
⑥密度測(cè)定
⑦曲面分析
⑧結(jié)合MATLAB引擎
⑨網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)計(jì)
4、展示狀語(yǔ)從句
創(chuàng)建高質(zhì)量的基于事件時(shí)間軸的交互式立體或非立體演示，并生成動(dòng)畫(huà)或視頻演示文件。
①動(dòng)畫(huà)制作工具
②高質(zhì)量的演示影片
③影片的生成
④多樣化的三維立體演示模型
⑤支持自動(dòng)立體演示
⑥二維和三維動(dòng)畫(huà)標(biāo)注展示

FEI Amira(三維可視化軟件)擴(kuò)展模塊

1、XBioFormats
提供其他生命科學(xué)文件格式支持
方便地加載 140 多種文件格式的三維或四維以上數(shù)據(jù)（由 Bio-Formats 與 Glencoe Software 合作提供支持）。研究人員現(xiàn)在可以從最新的顯微鏡以最新版本的支持專(zhuān)有文件格式讀取數(shù)據(jù)。

2、XNeuro
用于擴(kuò)散張量成像和灌注分析
此擴(kuò)展提供專(zhuān)用模塊，用于分析從 CT 或 MR 成像獲取的圖像。擴(kuò)散加權(quán) MR 成像 (DWI) 用于對(duì)組織（如大腦或肌肉）中的水?dāng)U散率進(jìn)行成像。通過(guò)此擴(kuò)展，用戶可計(jì)算表觀擴(kuò)散系數(shù) (ADC)、部分各向異性 (FA) 和方向編碼彩色 (DEC) 圖。擴(kuò)散張量成像 (DTI) 旨在定位并可視化人腦或靈長(zhǎng)類(lèi)動(dòng)物大腦中的纖維束，受多個(gè)模塊支持。通過(guò)跟蹤 MR 或 CT 圖像時(shí)間序列中的造影劑團(tuán)，支持腦灌注分析。

3、XMolecular
用于分子可視化
此擴(kuò)展結(jié)合了 Amira 強(qiáng)大的三維數(shù)據(jù)可視化功能（如硬件加速立體渲染）以及用于分子可視化和分析的特定工具（如分子表面、序列比對(duì)、配置密度計(jì)算和分子軌道動(dòng)畫(huà)）。Amira 用戶界面非常直觀，因此可以輕松使用此擴(kuò)展的各項(xiàng)功能。對(duì)于最常見(jiàn)的分子可視化任務(wù)，XMolecular 擴(kuò)展附帶自動(dòng)運(yùn)行的演示和分步教程。

4、XImagePAQ
用于高級(jí)圖像處理和定量
此擴(kuò)展為物體、細(xì)胞和組織特征的圖像增強(qiáng)、簡(jiǎn)化和自動(dòng)分割、廣泛測(cè)量和定量提供高級(jí)工具。

5、XMesh
用于三維幾何體生成
此擴(kuò)展使用四面體網(wǎng)格、矢量場(chǎng)可視化和復(fù)雜張量計(jì)算，為處理復(fù)雜表面分析、三維體重建的科學(xué)家提供高級(jí)功能。此軟件包專(zhuān)為有限元建模 (FEM) 設(shè)計(jì)，用于三維規(guī)則場(chǎng)、腦科學(xué)和三維流體動(dòng)力學(xué)模擬的計(jì)算分析。

6、XTracing
用于燈絲檢測(cè)
此擴(kuò)展允許在強(qiáng)噪聲圖像中檢測(cè)并跟蹤燈絲或管狀結(jié)構(gòu)，從而進(jìn)行各種分析，例如分析電子立體成像中的肌動(dòng)蛋白纖維或微管。

7、XWind
用于高級(jí) CFD/FEA 工具和數(shù)據(jù)導(dǎo)入/導(dǎo)出
此擴(kuò)展能夠在生物力學(xué)等應(yīng)用領(lǐng)域，對(duì)通過(guò)有限元分析 (FEA) 和計(jì)算流體動(dòng)力學(xué) (CFD) 模擬得出的數(shù)值解進(jìn)行分析、可視化和演示。XWind 具有主要格式的模型導(dǎo)出和模擬結(jié)果導(dǎo)入，增強(qiáng) Amira XMesh 擴(kuò)展。它還添加了這些模擬結(jié)果的高級(jí)后處理功能。

8、XLVolume
用于核外數(shù)據(jù)管理
通過(guò)此擴(kuò)展，Amira 能夠處理超出可用主要內(nèi)存的大數(shù)據(jù)集，例如在計(jì)算機(jī) RAM 較小時(shí)或在使用 32 位操作系統(tǒng)時(shí)。XLVolume 擴(kuò)展采用興趣體和多分辨率技術(shù)，可克服這些限制，并允許對(duì)海量數(shù)據(jù)進(jìn)行交互可視化和處理。根據(jù)可用資源，此擴(kuò)展允許探索超過(guò) 8 GB 的圖像量，并已成功測(cè)試，可處理超過(guò) 300 GB 的數(shù)據(jù)集。

9、XPand
用于開(kāi)發(fā)高級(jí)自定義模塊
通過(guò)此擴(kuò)展，您可以通過(guò)記錄完善的 C++ API 來(lái)開(kāi)發(fā)自定義數(shù)據(jù)類(lèi)型、可視化或處理模塊以及輸入/輸出例行程序，以此來(lái)擴(kuò)展 Amira。此擴(kuò)展擁有面向?qū)ο蟮恼Z(yǔ)言和開(kāi)放式設(shè)計(jì)，是滿足特定技術(shù)要求的理想方案。

10、XScreen
用于協(xié)作和沉浸式虛擬現(xiàn)實(shí)
此擴(kuò)展通過(guò)大型平鋪顯示和沉浸式虛擬現(xiàn)實(shí)配置（如 CAVE），實(shí)現(xiàn)高級(jí)數(shù)據(jù)可視化和分析。XScreen 擴(kuò)展支持多通道系統(tǒng)上的高效多線程渲染和集群系統(tǒng)上的分布式渲染，提供最佳性能，而帶寬要求極低。它還支持主動(dòng)或被動(dòng)立體、邊緣融合、頭部跟蹤、三維交互，讓您在使用 Amira 功能時(shí)獲得真正的沉浸式體驗(yàn)。

常見(jiàn)問(wèn)題

1、Amira 是否利用多個(gè)處理器？
是，Amira 在許多情況下使用多處理器系統(tǒng)，例如圖像濾波器。
2、對(duì)顯卡可使用的紋理尺寸是否有限制？
有限制。精確值視顯卡而定。一般的限制是，每個(gè)二維紋理為 2048x2048 像素，三維紋理為 512x512x512 像素。在某些體系結(jié)構(gòu)上，對(duì)可用紋理內(nèi)存總量也有限制。這對(duì)于立體渲染模塊等基于紋理的立體渲染特別重要。